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计算平台
2021.02.08

      国家血液系统疾病临床医学研究中心计算平台搭建了拥有生物信息平台和生物统计的完备数据科学团队,汇聚了来自海内外的众多高层次数据科学人才。

      生物信息平台依托中心的高性能计算集群,集管理、服务与科研为一体,服务国家中心的临床研究。平台主要负责与临床和课题组紧密合作科研项目,进行个性化数据数据分析,发表高质量科研成果,并进行算法开发和数据挖掘等。此外,作为重要的支撑,平台安装并维护生物信息共享的软件和注释数据库,负责标准化数据分析流程的开发,形成公共资源共享。与此同时,构建血液学和血液疾病数据库,例如血细胞图谱数据库、血液病多病种多组学测序数据库等。通过合作和培训整体提升研究人员的生物信息的分析能力。

      在计算资源方面,建成了由CPU+FAT组成的异构高性能计算系统。其中高性能运算集群由12个CPU节点组成的刀片服务器系统,CPU核数达到336,内存1536G,以及由80个CPU核和1TB内存组成的胖节点。生物信息平台还与公司合作开发了在线大数据管理和标准化分析平台,集数据管理、检索、访问功能与标准化数据处理、分析、可视化于一体。配有14种分析工具,其中包括完善的单细胞转录组分析工具,以及全外显子组、转录组等数据的分析工具。

      生物统计室集服务与科研为一体,密切跟踪国际血液病流行病学的发展方向和趋势,为科研项目提供流行病与生物统计学支持,合作开展科研项目工作。具体工作包括:

      1. 配合临床、课题组、平台等部门以及外部合作机构为临床研究提供标准与卓越的统计学设计与评价;为数据库管理和数据分析提供统计学支持;为医护人员及科研人员提供方法学咨询;

      2. 合作开展科研项目,参与临床研究的设计、实施、分析、质控和解释性研究。协助学术带头人和临床科研人员进行临床试验和流行病学课题研究,包括开展血液系统疾病的流行病学调查、建立重大血液疾病纵向队列、开发重大血液疾病全维度医学数据预测模型等,发表高质量科研成果。

      3. 开展项目设计、数据管理和统计分析的培训讲座和案例解读,提供SAS、R、SPSS等统计软件教学,以整体提升研究人员的项目设计和统计分析能力;

      4. 提供各类型研究研究方案和发表论文的模板,为撰写规范化的科研方案和高水平的科研成果提供参考;提供常见统计问题汇总一览表,为科研工作者常见的数据分析问题提供帮助。